Αυτή την περίοδο το Ινστιτούτο Αρχιπέλαγος ολοκληρώνει το σχεδιασμό μίας σημαντικής έρευνας που θα υλοποιηθεί σε διάφορες περιοχές του Αιγαίου, σε συνεργασία με το Περιφερειακό Κέντρο Δράσης των Ηνωμένων Εθνών για τη Μεσόγειο (UNEP/MAP RAC SPA).
Αποτελεί μία πρωτοποριακή δράση, καθώς για πρώτη φορά στη Μεσόγειο θα γίνει παράλληλη έρευνα των λεγόμενων Δεικτών Βιοποικιλότητας, δηλαδή τα θαλάσσια θηλαστικά, χελώνες και θαλασσοπούλια, τα προστατευόμενα οικοσυστήματα (λιβάδια Ποσειδωνιας και κοραλλιγενείς ύφαλοι) και τα εισβολικά θαλάσσια είδη.
Οι δράσεις αυτές, στοχεύουν στην καλύτερη εφαρμογή της Οικοσυστημικής Προσέγγισης που έχει υιοθετηθεί από τα Ηνωμένα Έθνη, δηλαδή στην προστασία των οικοσυστημάτων και των παράκτιων κοινωνιών, και όχι στην προστασία μεμονωμένων ειδών.