Παράλληλα με την περιβαλλοντική έρευνα και τις δράσεις προστασίας του Αρχιπελάγους, τα τελευταία χρόνια πειραματιζόμαστε και με τις μικρής κλίμακας εφαρμογές ανανεώσιμων πηγών ενέργειας (ΑΠΕ). Η ομάδα έρευνας ΑΠΕ του Αρχιπελάγους είναι μία από τις πιο δημιουργικές και δραστήριες ερευνητικές μας ομάδες. 
Πειραματίζεται και χρησιμοποιεί μικρής κλίμακας ΑΠΕ όπως οι ηλιακοί αφαλατωτές, οι ανεμογεννήτριες, τα φωτοβολταϊκά, τα ηλιόθερμα, το βιοντίζελ (που παράγουμε ανακυκλώνοντας μαγειρικά ελαία), το βιοαέριο (που παράγουμε ανακυκλώνοντας οργανικά απορρίμματα κουζίνας), οι ηλιακοί φούρνοι αλλά και το ηλιακό κάτοπτρο του Αρχιμήδη. 
Όλα αυτά θα μπουν σύντομα σε πλήρη εφαρμογή στο ερευνητικό κέντρο του “Φυσικού Θαλάσσιο Καταφυγίου» των Λειψών, το οποίο θα λειτουργεί αξιοποιώντας αποκλειστικά ανανεώσιμες πηγές ενέργειας, έχοντας μηδενικό περιβαλλοντικό αποτύπωμα.
